En cuanto a la ubicación de la úlcera, se encuentra en el sistema genitourinario. En los hombres, la úlcera de sífilis aparece en el pene, especialmente en el frente (glande del pene) o dentro de la uretra, seguida de una secreción viscosa del conducto, ya sea en la mujer, la úlcera aparece en la vulva, la uretra y el cuello uterino. En las mujeres, la primera etapa a veces no aparece y la enfermedad se diagnostica en la segunda etapa. Se encontró sífilis en los labios, el ano, los dedos, la faringe, la lengua y los pezones en el 10 por ciento de los infectados.
Después de aproximadamente una semana de úlceras, los ganglios linfáticos se hinchan, y debido a que el sistema reproductivo está infectado, las glándulas linfáticas que se hinchan son los ganglios linfáticos de la ingle hacia el área púbica superior en los lados y la parte superior de los muslos, y generalmente curan las úlceras dentro de 4 -8 semanas automáticamente o con la cura.