Hay varias categorías de fístula anal. Estas categorías incluyen fístula anal alta y fístula anal baja. La fístula anal alta es el área donde se encuentra la cavidad rectal en la región superior. El riesgo de incontinencia fecal es muy alto. Fístula El ano inferior está en la parte inferior de la cavidad rectal y el riesgo de incontinencia fecal es menor.
La otra clasificación es simple y compleja, se llama complejo cuando el canal de la fístula corta todas las válvulas anales internas y externas, o cuando el tratamiento de la fístula es difícil o si la fístula afecta los órganos adyacentes. La última clasificación es la clasificación más común de la fístula a medida que pasa a través de las válvulas o hacia afuera. El primer tipo es la fístula en las garras y forma el 45% de las especies, y refleja la fístula durante la válvula anal interna, pero no pasa a través de la válvula anal externa
El segundo tipo es el tipo triturador cruzado, que constituye el 45% de todas las especies. Pasa a través de los egipcios internos y externos juntos y luego al área de la cavidad rectal para llegar a la piel del mecanismo. El tercer tipo es el tipo que pasa sobre las jeringas. Y el cuarto tipo es el que sale del esfínter y se extiende desde la boquilla interna del intestino hasta el recto inmediato e incluye el aparato de las catacumbas en su totalidad.